秦朝官制之中的御史大夫，独立于丞相之外，直接向帝皇负责，监察百官的设定，扶苏一直十分满意。
后世的三省六部制，吏部虽然也有类似的职能，但是直接属于尚书省统辖，低了尚书令等三省主官一头，是否能起到足够的监督，就要打一个大问号了。
因此扶苏决定将御史大夫的设置延续下去，并且进一步强化，除了朝堂之外，在各郡县也都要设立分支，进一步完善监察职能。
太尉实际上是一个最尴尬的位置，毕竟军权向来是最容易被帝皇忌惮的。
王翦之所以三天两头称病不上朝，最大的缘故，就是为了避嫌。
不过若是学习后世，将太尉改为虚职，实际领军由兵部执行，就会形成文官低于文官，被文官打压的局面，对于大秦十分不利。
因此扶苏决定，将太尉改组为枢密院，功能类似于后世的总参谋部，负责协助帝皇指挥军队作战，军队编制规划建设、后勤动员等。
但是最重要的钱粮，必须经由三省审批之后由帝皇进行决议。
只要收住了钱袋子，光有兵无钱粮，再加上军队之 中爱秦主义，服从帝皇的教育，枢密院就对帝皇构不成威胁。
如此一来，既保留了武将的地位，也防止了武将权柄过高的可能，更有利于中央集权统治。
三公之外的九卿，分别是卫尉、郎中令、太仆、廷尉、典客、奉常、宗正、少府、治粟内史。
另外还有一个被扶苏提议，始皇帝通过提升为和九卿一致的将作少府。
如今既然要改革，将作少府完全可以直接改组为工部，更符合扶苏对其定位。
治粟内史，也可以直接改组为户部，掌管国库税收，负责平抑物价、海关进出口审批等。
廷尉府是大秦最高司法机构，可以改组为刑部，进一步加强其职能。
典客署，类似于后世的鸿胪寺，可以和国子监一起，成立大秦礼部。
毕竟如今大秦是真正的天朝上国，外.交纵横完全是大秦说了算，拳头大才是真理。
战场上拿不到的，谈判桌上更不可能拿到。
过于重视，只会让某些文人过于得势，最终就是跪族风气。
掌殿中议论、宾赞、受奏事、宫廷宿卫之事的郎中令，在扶苏看来，职权有点过于广泛，言官好好行使好弹劾和监察工作就行，职能应该是类似于后世的检察院，和刑部互相配合，互不统属，将秦法的公平公正性一直贯彻下去。
掌宗庙祭祀礼仪的奉常，掌皇家车马的太仆，掌皇族宗室的宗正，掌管掌皇帝私产的少府，在扶苏看来都不适合列入九卿之中，可以合并成为内务部门，直接归属帝皇管理，负责为帝皇打理內库。
对于国库和內库的区分，扶苏还是比较赞同的。
而且內库花起来也比较方便，朝野上下都无话可说。
掌皇宫诸门屯兵的卫尉，也就是大秦御林军，肯定也要直属帝皇管理，皇帝不能亲自指挥御林军，后世可是有着太多的经验教训。
而后世三省六部最后一个兵部，扶苏迟疑了许久，最终还是将其加入到尚书省之中。
不过职能却受到了一定的削减，拥有的是非战时的武将考核和俸禄发放，也就是负责管理军队的编制和钱粮，归入尚书省之中。
一旦进入战时，兵部的权限就要被收回，帝皇可以根据具体需求，决定是否将权利移交给枢密院。
如此一来，大秦的新的朝堂体系，也就被扶苏完全梳理了出来。