在海湾野蛮人行动中，新指挥官在长间晋三的帮助下被授予了欧米茄百合子的指挥权，以重新控制横滨港的基地防御，他们设法重新启用海军码头，从而允许他们进入强大的战舰，在那里他们使用这些战舰挫败敌人大胆的攻击，攻击是由蓝国联盟的利塞特和红国联盟的库可夫将军领导的红国联盟发起。
橙国横滨袭击失败后，他们再次被用来协助将军刽子手破坏红国联盟总部，以夷平这座城市，并使库可夫将军和总理查丹科无法再与他们为敌（实际上是为了摧毁红国联盟的时间机器）。
幕府将军战舰在最后一次橙国战役中摧毁了两台质子撞击炮，以及在格雷戈·泽林斯基博士最后一次试图阻止旭日橙国的力量之前，摧毁了未来科技总部，格雷戈·泽林斯基博士最后还是失败了。
幕府将军战列舰是非常有效的反舰舰艇，由于其射程远，最好用于夷平海岸附近防御森严的敌人基地。建议船舶侧向放置，以便它们可以利用两个炮塔同时发射所有六枚炮弹。他们也是极高效率的海军轰炸支援，可以协助薙刀巡洋舰作战，协助对付敌人的海军单位。
幕府将军战舰几乎没有弱点：它是一艘重装甲战舰，拥有三级战舰中最强大的火力，加上出色的射程。它经常与薙刀巡洋舰和海翼潜艇一起使用。然而，如果一支敌军部队设法突破薙刀巡洋舰，幕府将军战舰完全有能力在近距离内通过简单的撞击敌人进行自卫，有效地摧毁任何三级战舰，如航空母舰或无畏武库舰，甚至是突击队员，如娜塔莎，但事实证明，谭雅对他们来说是一个噩梦。
在标准的一对一战斗中（不使用特殊能力），一艘普通幕府将军战舰可以击败一艘红国联盟无畏战舰或一艘蓝国联盟航空母舰，即使只使用一个炮塔，使用两个炮塔将使其火力加倍，并缩短摧毁任何两艘敌对主力舰的时间。然而，后来的游戏补丁分散了大炮的炮击，有效地减少了每次反冲的伤害，并降低了与其他主力舰的一对一战斗中的效果，除非它们是正面的（尽管即使使用一个炮塔，它仍然可以击落无畏武库舰），但大多数情况，将军战舰从侧面发射两个炮塔。此外，分散的射击使其对敌军步兵或车辆造成更大的有效区域伤害，并且对大型建筑仍然有效。
然而，幕府将军战舰并不完美，它很容易受到空袭。双刃直升机、世纪轰炸机和维护者轰炸机以及新的先驱者炮舰机，简直是最大的威胁。冷冻直升机也有助于将其摧毁。通常来说，形成“狼群”的阿库拉潜艇也可以有效地击沉它们，恐怖无人机也可以，它们速度太快，无法被大炮跟踪。因此，防空和反舰护航通常是必须的。
幕府将军战舰可以升级额外的传感器、装甲和其他具有橙国秘密协议的装备。该协议还改变了受影响舰船（包括战列舰）的外观。机组人员还接受了其他协议方面的培训，他们将减少推进资源，并在特定时间内使用火力。
与其他橙国单位一样，幕府将军战舰也受益于机器人装配升级，从而缩短了建造时间，成为红色警戒三中建造最快的主力舰。
将军战舰的原型是橙国的大和战舰，有趣的是，大和战舰的四百六十毫米舰炮被假消息掩盖为四百毫米航炮，将军战舰也是一样的情况。不过大和战舰不像将军战舰那样，那么受橙国大众的欢迎。
具有残酷讽刺意味的是，一艘像旭日橙国的幕府将军级战舰那样雄伟的战舰，其破坏力之大，令人生畏。虽然它是橙国海军的旗舰，但它的装饰性和象征性本质仅仅是对其作为纯粹用于沿海轰炸和远程反舰作战的船只角色的点缀。不幸的是，红国联盟军队直到最近才意识到这些细节，当时橙国出人意料地对红国联盟北部海岸发动进攻，轻易摧毁了那里的大部分防御。
幕府将军战舰是皇帝整个军队中最大、最昂贵、在许多方面最强大的武器，从未见过大规模生产。然而，由于它们往往是橙国攻击群中防御和支援最为严密的部队，因此很少有人知道这些坚固的船只甚至只需要小程度维护。他们的武器装备仅限于六门主炮，沿船首和船尾分为两排，每排三门，使幕府将军战舰舰炮能够通过三百六十度的射击覆盖来补偿其缓慢的转弯速度。然而，正如预期的那样，他们必须转向侧翼，以便用全部舰炮攻击目标。虽然这些火炮的形状与过去几年战列舰的形状毫无疑问相似，但事实证明，它们经过了改装，可以发射某种能量的射弹，而炮管本身为这种强大的武器提供了惊人的射速。
战场侦察至少揭示了幕府将军战舰的这些事实。
白田加农炮——幕府将军战舰每艘配备六门大炮；两个炮塔各有三个炮管，一个在船头，一个在船尾。虽然功能类似于传统的四百六十毫米战列舰加农炮，但白田加农炮的过热弹头更具破坏性，更精确。
撞击速度——虽然幕府将军战舰上的火炮无法追踪附近的目标，但这些战舰在近距离内远未失去防御能力。他们的舰长随时准备给引擎增压，直接冲破任何敢于靠近的敌舰。
最高标准——存在两种幕府将军战舰，其中一种更为罕见，留给最受尊敬的舰长和指挥官。这些强化的幕府将军战舰可以通过它们的装饰性旗帜来识别，并且总的来说比它们的对手更强大。
为了形成无敌的舰队——橙国海军的严格规范规定了各种舰队要素之间的共生关系，将它们的生存与合作联系起来。结果，幕府将军战列舰没有装备任何防空武器了，使它既有纯粹的目的，又有明显的弱点。
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