常磐市郊外，一个冒着青烟的环形坑洞里。
“好……好讨厌的感觉啊……”武藏、小次郎和喵喵浑身焦黑，呈“大”字型躺在坑底，尾巴还在冒着电火花。
“武藏……我、我们是不是……”小次郎颤抖着开口，“……惹到了一个怪物？”
“啪！”武藏反手就是一巴掌，虽然她自己也在抖。“闭嘴！你这个懦夫！什么怪物？那只是一个……一个……”
“一个‘原型机’，喵！”坑洞中央，喵喵猛地坐了起来，它的双眼在放光，仿佛发现了惊天大秘密！
“原型机？”武藏和小次郎一愣。
“你们还没明白吗，喵？！”喵喵激动地比划着，“我们刚才在哪里？常磐道馆！那底下是什么？坂木老大的秘密基地，喵！”
“那个小鬼为什么会出现在那里？那只皮卡丘为什么会有那么恐怖、那么精准的力量？！”
“我全明白了，喵！”
喵喵露出了“名侦探”般的笑容：
“那只皮卡丘！它根本不是普通的皮卡丘！它是一个**‘原型机’！是坂木老大藏在道馆里的‘终极秘密武器’，喵！”
“那个小鬼，”喵喵的语气变得凝重，“他根本不是什么新人训练家！他是坂木老大的**‘秘密研究员’**，但他背叛了，他把‘原型机’偷走了，喵！”
“原、原来如此！”武藏和小次郎瞬间“恍然大悟”。
“难怪！”武藏站了起来，“那两道细得看不见的电流……那种精准到变态的控制力……那是‘科学’的力量！”
“没错！”小次郎也重燃斗志，“我们不是输给了小鬼，我们是输给了坂木老大的‘最高科技’！”
“所以，喵！”喵喵跳到了坑边，高举双爪：
“我们短期的新目标就是——夺回那只‘原型机’皮卡丘！只要把它献给坂木老大，我们就能升官发财，走上人生巅峰了，喵！”
“没错！”
“就是这样，喵！”
三人组自认为找到了真相，再次燃起了斗志，朝着常磐市的方向鬼鬼祟祟地摸了回去。
【宝可梦中心的“临时实验室”】
常磐市宝可梦中心，最高级的VIP病房。
这里现在已经看不到任何医疗器械，取而代之的是各种闪烁着数据流的屏幕。
小智已经将自己的战术终端，强行“并联”到了乔伊小姐那台最先进的“高级伤药合成仪”上。
“老板……你、你把乔伊小姐的机器弄得直冒烟……”小霞在一旁看得心惊肉跳，“这真的没问题吗？它好像快炸了……”
“安静。”
小智头也不抬，他的手指在虚拟键盘上快出了残影。
“这台机器的‘合成逻辑’太原始了，只会进行低效的‘草药物理混合’。我正在给它安装一套基于Gene_Editor_v2.0（基因编辑器）的‘生物炼金’模块。”
在他的主屏幕上，从坂木基地下载的Project…….Log（超梦日志）数据正在被飞速解析。
[解析完毕：‘梦幻’基因序列具备‘万能适配性’。]
[方案生成：已成功提取其‘基因桥接’代码。可制造一种‘通用型’基因优化液，用以强行打破低等宝可梦的‘种族值枷锁’。]
“就是这个。”
小智将小霞采购来的A3（生物角蛋白）、B7（高纯度电解质液）、C2（神经元催化剂）三种营养品。
按照：
0.314
1.772
0.901的恐怖比例，依次倒入合成仪。
“嗡——嗡——！！”
被强行“刷机”的合成仪发出了不堪重负的轰鸣，剧烈震动起来！
小霞吓得躲到了门后。
“叮——！”