“人具有无限多样‘性’。”赫希菲尔德称，已被觉察的人类性行为有千万种，这说明“爱与人一样多变”。基于此，应该提供一种科学的方式，帮助“中间性”者成就自身，并重获社会认可。这应惠及所有二元性别以外的性别，包括女同性恋者、男同性恋者、双性恋者、跨性别者等。
1913年，赫希菲尔德携手伊万·布洛赫（Iwan Bloch）等人，在柏林创办“性医学和优生学会”，展开一系列学术研讨。
1919年，他用全部家当，购买一栋楼，挂上“性学研究所”（Institut für? Sexualwissenschaft）的门牌。史料记载，研究所工作包括三方面，开展性学、社会学研究，提供包括婚前指导、性保健等临床服务，以及医学法律援助。
来自欧洲各国的研究人员、医生、同志们，到访该研究所，为的是增加对性的了解，以及免费咨询自己的性关系问题和性功能障碍问题。开业仅1年，研究所就积累了近2万份病案。
1921年，研究所扩建礼堂、图书馆和实验室。尤其值得一提的是图书馆。10年间，其收藏书籍达2万余卷，照片5000余张，各类艺术品3万余份，以及保存约4万份“中间性”者自传体材料。
1930年，研究所又创出一个“世界首例”：赫希菲尔德邀请妇科医生路德维希·莱维·伦兹（Ludwig Levy-Lenz）和外科医生埃尔文·格尔班特（Erwin Gohrbandt），共同完成第一例性别重置手术。
接受手术者名叫莉莉·艾尔伯（Lili Elbe）。手术成功切除其男性生殖器官，用其自身皮肤进行**再造。外科医生试图为其做卵巢移植，以失败告终。1931年，艾尔伯再次接受子宫移植手术，期望达到真正的“变性目的”。不幸的是，术后因严重的排斥反应而病逝。
这一开创性手术引起国际关注，也吸引大量“中间性”者的关注。此后，陆续有人找上门，希望接受性别重置手术。因技术所限，当时研究所仅能完成男性到女性生殖器官的重置，包括用**皮肤再造**。术后，医生会医嘱使用激素药物，使术者上围更具女性特征。
但遗憾的是，有些性别重置为“女”者，难以获得工作、维持生计。有5名术后女性因此成为研究所的雇员。
在赫希菲尔德的努力下，20世纪头30年里，德国对“中间性”者的态度非常宽容。到1920年时代，同志文化在柏林等城市蓬勃发展。德国国会传出消息，称在考虑废除刑法第175条。
1930-1932年，赫希菲尔德开始“环球巡讲”。他的足迹遍及美国、日本、中国、印度、菲律宾、印度尼西亚、埃及、巴基斯坦等。各国医学界、科学界盛赞其为“性学爱因斯坦”。
在研究所“成立十周年”庆典上，与会嘉宾都认为，一个更大胆、更美好的未来或将开启。
但1933年，一切戛然而止。**上台伊始，就开始严厉打压同性恋群体。同年5月，希特勒政府下令关闭性学研究所。**党徒、士兵蜂拥而至。他们推倒赫希菲尔德的铜像，把所有书籍、资料堆成山，扔出一个又一个火把。
和藏品一起付之一炬的，是赫希菲尔德所有的家当。彼时，赫希菲尔德恰好在海外巡讲。他被驱逐出境、逃亡国外。
也是在翻查过程中，**看到了性学研究所的病案资料。那些过往前来寻求帮助的人们，陆续被列入“粉红色名单”。
“一战时，德国战败，尸骨如山。如果没有足够的人口、孩童，德意志民族如何万古长青，同性恋必须被连根拔除。”在这暴虐认知下，集中营设立专门的识别体系。每个囚徒都要佩戴三角形章，黄色代表犹太人，红色为政治犯。粉色则是同性恋。
士兵们兴之所至，会到集中营里拉出一群同性恋，让其站在远处，以粉红三角章为靶，练习枪法。**的军队医生开展“人体研究”，活体切割男同性恋的身体，试图寻找其同性恋基因（Gay gene），以求治愈有同性恋倾向的“优秀日耳曼少年”。
1935年，**当局对刑法第175条做了更严厉的“修正”：“违背自然的淫乱行为”中“违背自然”这一定语被取消。同性之间接吻或“抛媚眼”，都可以被定性为“淫乱”，从而被投入监狱。根据同一时期出台的刑法175条附加a款，“严重同性淫乱”的最高处罚可达10年监禁。
二战后，德国政府释放犹太人，却继续收押同性恋囚犯。直到2002年，德国政府才向受**迫害的同性恋群体道歉。
赫希菲尔德至死都没能再回到德国。
1935年，他于法国尼斯逝世，终年68岁。身兼学生和爱人双重身份的李修棠（Li Shiu Tong），陪其走完人生路。两人结识于1931年的中国上海。“我曾想学业有成后，去中国香港开性学诊所。但赫希菲尔德走了，带走了我的一切。”李修棠书写回忆录道。
尽管赫希菲尔德的许多观点在今天看来已经过时，但它向人们提供一种思路，拓宽人们描述和理解性偏爱。这具有开创性意义。
1990年5月17日，世界卫生大会决议，将同性恋自疾病分类中删除。5月17日后来成为“国际不再恐同日”（International Day Against Homophobia）。
2001年，中国亦实现“同性恋”去病理化。中华精神病学会推出第三版“中国精神疾病诊断标准”（CCMD-3），将同性恋从精神疾病分类中删除。
德国刑事法第175条在赫希菲尔德死后60年，终告废除。
2011年，德国政府成立“马格努斯·赫希菲尔德德国联邦基金会”，以消除对同性恋及跨性别群体的歧视。“赫希菲尔德在争取性少数群体权利方面的贡献，是公认的。他是将性学当作独立学科进行研究的创始者之一，是一位积极为同志争取权利的先驱，更是一位将性学与人性、权利连接起来，并奋战不懈的科学家。