?就在日向方圆进展顺利的时候此时的木之叶普通村人仍旧将鸣人当做妖狐的化身，对他冷眼相待，鸣人为了得到大家的认同而不断在村里搞恶作剧，以引起人们的注意。鸣人的目标是成为村子里最伟大的忍者“火影”，让所有人认同他的存在。其中同鸣人一个班的春野樱的姐姐春野凰和普通学生鲜于子美最为同情常常扮演亲人的角色。
在忍者学校是万年吊车尾的鸣人，在打倒水木拥有封印之书并打算出逃大蛇丸的野心后终于得到伊鲁卡老师的认同而顺利毕业，并和同期毕业的佐助、小樱分配到同一小组。指导上忍卡卡西为了培育鸣人他们的团队合作精神而在生存训练中设下各种考验，最终判定他们合格，也使得鸣人他们学习到了团队合作的重要性。另一面日向那那美为指导上忍日向方圆、春野凰、鲜于子美为团队的虚数小队结成同盟针对另外三名虚数参赛者。
等鸣人一行在三代火影猿飞日斩手中卡卡西小组终于收到了第一个a级任务，当然他们并不知道这个保护造桥专家达兹纳回到波之国的任务有多难。指导上忍卡卡西为了培育鸣人他们的团队就在任务途中培养他们，他们遭到雾忍者村的叛忍桃地再不斩的攻击，这也成为了他们的第一次实战。众人在战斗中各自都有所成长，也了解到了忍者世界的残酷性。
鸣人他们完成任务回到村子，卡卡西推荐他们参加即将举办的中忍考试。考试会场中强手云集，而在考试过程中，鸣人他们遭到原属木叶忍者村、已经叛离村子的大蛇丸的攻击，佐助也被大蛇丸在身上留下了咒印。之后，鸣人和佐助顺利通过预选赛，并为即将到来的正式考试作准备。鸣人得到木叶三忍之一的自来也传授忍术，而佐助则是受到卡卡西的专门指导。但与此同时，大蛇丸正在暗地里酝酿着阴谋，那就是联合砂忍者村一同袭击木叶。
鸣人在正式考试的第一场击败了人称天才的日向宁次，向大家证明了自己的实力。但在考试中途，音忍和砂忍们开始向木叶忍者村发动攻击，考试也被迫中止日向那那美为指导上忍日向方圆、春野凰、鲜于子美为团队的虚数小队便在方圆的刻意引导下参与了战役。大蛇丸向第三代火影发起挑战，在一场激战过后，第三代火影战死，而大蛇丸也付出了失去两只手臂的代价，被迫撤退。鸣人则与砂忍者村派来的“兵器”我爱罗交手，并打败了我爱罗。
木叶忍者村由于大蛇丸的阴谋而受到极大的损伤，就在此时，已经叛离木叶的宇智波鼬突然现身。鼬是佐助的哥哥，曾经将一族的人们全部杀光而离开村子，这次他与雾忍者村的干柿鬼鲛一同来到木叶，似乎是以鸣人体内的九尾作为目标，并且是受到名为“晓”的组织的命令。
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