隐士云石，搭乘生物飞船方舟号途中遇到星际风暴，危机时刻获得M系统传承，在飞船解体之际召唤田胖子进入M系统自带空间，躲过一劫。风暴过后，穿过虫洞，来到地球。穿越、M系统、方舟号飞船、星际风暴，一切都与预言中的宇宙终结有关。云石踏上寻找M系统起源以及阻止宇宙终结的道路。