一切从近未来的某一天开始，当时人工AI的机器人服务于人类生活的各个领域。
这天，一台人工AI的机器人突然爆走杀死了它的人类主人，这次事故引发了类似消灭“有狂犬病的疯狗“的运动。
人类社会对人工AI的机器人进行了蛮不讲理的“屠杀“和“驱赶“，大部分人工AI机器人被破坏。
一小部分被抛弃的人工AI机器人汇集到一个被人类抛弃的地方开始了自立的生活（大约在中东地区某地，在那个时代估计中东的石油早被开采尽了，于是就成了荒漠）.
但那个原来很渺小的利用太阳能作为动力的机器人国家迅速强大膨胀，这不可避免使之的和人类发生接触和摩擦。
在某一天的联合国大会上，两个人形的机器人大使试图使“机器国“加入联合国，但人类认为这是奇耻大辱，当场驱赶了机器人大使。
其后机器人帝国和人类国家的各种摩擦升级成全面战争，但人类的血肉之躯难以抵挡机器人的进攻，战争中人类节节败退。
输红眼的人类终于拿出终极武器“核弹“，但大规模的核爆没有能对机器人方面造成实质的毁灭，核爆后的放射污染对机器人根本无效。
机器人的强大攻势丝毫未减，已经山穷水尽的人类这时通过了一个“遮蔽天空“的战斗计划。
因为机器人的能源供应是依赖太阳能的，如果切断太阳能，机器人的能源供应就会出现短缺，转换能源供应体系不是短时间内能办到的（至少在人类社会里以上理论是成立的，但是对机器人....）
就在这个时候，发动最后的反攻一举扑灭所有机器人。
于是人类开始了这个疯狂而愚蠢的计划，没多久地球的天空被一层黑色不透光的云遮蔽。
但是人类期待的情况并没发生，出现能源短缺的机器人并没有大批的瘫痪。
他们就地取材得把战场上受伤的人类战俘当作临时“电池“
（这是MARIX产生的最初动机，当时只是把人类简单的一排排得接在机器上，通过刺激人类的脑部使人类的身体发电，但连接在机器上的人类很快会死亡，死亡意味着电池没电，为了使电池的寿命更长久，机器人才开始研究人类的脑部，并完善了食物供应体系，使人类在连上机器后能存活更长时间）。
机器人击退了人类集中所有力量的最后反扑，在消灭了人类最后的政府后，人类所有有组织的抵抗宣告结束，人类的时代宣告终结。
其实机器人也因为人类遮蔽了天空能源出现的问题，虽然把人类战俘当电池用暂时解决了危机，但是短时间内转换能源供应体系也非易事，只有先把更多的人类当做电池来解决眼前的能源短缺。
于是大批的人类被抓去当做电池，最后几乎所有地球上人类都被当电池，可是被当作电池的人类会很快死亡。
于是已经对人类脑部有了相当了解的机器人开发出了可循环的人体电池系统，人类的脑部连接在一个电脑虚拟的空间里，这就是最初的MARIX系统。
在这个系统里，人类是生活在完美的世界上，所有欲望和需要都被满足，机器人以为这样的系统可以使人类长久的生存。
但是对人的情感世界缺乏了解的机器人错了，连接在这个完美世界里的人类电池大量死亡......
现在进入电影里的MARIX世界，这里的MARIX是模拟人类某个历史时期。
大多数人类并不知道自己生活在虚幻的世界里，但是这个虚幻的世界并不十全十美无懈可击。
在世界的某个角落里总是存在着一些或大或小的BUG（如动画版里小女孩发现的奇妙废弃大楼）。
还有人类中的某些特殊体质的个体似乎能超越系统的控制（动画版里超越体能极限的短跑高手）。
更有甚者一些程序和人类接触中有了自我意识，他们学会了逃避系统的删除。
这些难以估计后果的错误有可能导致整个系统的崩溃，对此早期的MARIX是用亡羊补牢或对知情者灭口的消极方式加以应对。
可是这样的运转模式显然无法长久，问题是会越积越多的，修补系统错误带来的可能是更多的错误，必须有一个方法定期对系统进行“大清洗“并重新启动。
这个计划的开端是设立ZI这个人类觉醒者的收容所，由于对人类觉醒者的杀戮往往导致更多人的觉醒。
与其如此，不如把这些觉醒者踢出系统，并且统一监管起来。
ZI与其说是人类自由的乐土不如说是一个大监狱，为什么这样说，要知道ZI是MARIX派出的人建立的（位置MARIX当然是早知道的）。
而这些人理所当然的成为ZI的领导层，所有人实际上是在MARIX控制的人监管之下。
由于人类是有繁殖能力的，ZI的扩张也是必然的，为了防止ZI因强大而失去控制，所以MARIX要定期毁灭ZI（举手之劳而已），而这个过程和MARIX的升级计划合二为一。
第二步是创造一个人类觉醒者所崇拜的“先知“。
由于MARIX对人类长期的研究发现，人类是非常迷信的（人类把这个称为信仰），对“奇迹“还是“圈套“缺乏理性的判断力（有些看电影的人还一直坚持认为先知是在帮助人类.....连看电影的人都被迷惑了....）。
先让先知给那些“反抗军“少许“甜头“，然后就可以把这些家伙在MARIX里的行动也控制起来。
实际上电影里无论莫非斯还是E所有的行动都是那个先知提示的，他们在有所行动前已经习惯性的要到先知那里去“批命“。
这种精神控制的手法其实一点也不新鲜。
人类社会的邪教组织一向都是用这样的手法，区别是邪教一般是用一些小骗术来骗取他人的信任，而这个先知是通过高速电脑事先计算出未来事件的发。
（所以这些事都不是一定会发生的，是需要先知这样的角色来引导或诱发才能达成的）来取得人类的信任。
第三步就是给这些ZI的人类创造一个虚幻的希望“HEE“，也就是电影中的主角E。
他还有一个作用，由于那些逃避删除的程序熟悉MARIX的操作手法，他们可不会吃“先知“的那套把戏，要对付这些“危险的系统垃圾“也需要借助这个特殊的角色。
在电影里，E在先知的诱导下（让他去找钥匙人）去踢了fa国人的场子，消灭了他很多能力强大的手下。
为什么不消灭fa国人，因为fa国人起的也是类似ZI的作用，他把逃避删除的程序收集起来当做手下，就象把垃圾扫到垃圾桶里（fa国人说白了就是一扫地的）。
这样才好一次倒掉（由HEE来负责一次倒掉），估计每次MARIX升级都会有个HEE听了先知的引导，到fa国人这里来打砸一翻，所以fa国人对先知的这种手法既痛恨又无奈，这也是他想要挖先知眼睛的原因。
第四步就是开始清理系统内外，这个步骤需要先知的诱导和E的强大能力、
首先是使E获得能力并对先知言听计从，这段过程大概是黑客第一集的内容。
然后就是对系统内的逃逸程序进行打击，先知以找钥匙人为诱饵，让E一伙和fa国人的手下火拼。
结果fa国人手下全灭，fa国人夫妻出于对这个“游戏“玩法的了解始终没有出过手（不但没出手还提供帮助，fa国人老婆在意味不明的一吻后提供了帮助，谁知道不是他们两夫妻事先约好的？）。
这个过程在电影第二集里有详细描述。最后是对ZI进行清理，消灭ZI所有的战斗力量，早就知道ZI位置的MARIX不费吹灰之力就把ZI的反抗力量消灭，这些内容在第三集里有详细描写。
最后的一步比较麻烦，就把HEE神话毁灭，并排除先知的所有的“嫌疑“。
然后在所有在MARIX里的人类都没有察觉的情况下重新启动MARIX（我猜想可能是类似于更换一下游戏服务器主机）。
其中HEE这个角色在整个计划中是即必不可少又相当危险的，对这个角色的控制不当会有非常严重的后果
（这从黑客最后建筑师和先知说的那句：“你玩的是非常危险的游戏“可以知道）。
消灭E是一个难题，MARIX对此的对策就是史密斯SMIH。
在第一集里史密斯SMIH只是一个性格古怪个体意识很强的“杀毒程序“，他对MARIX系统的不满情绪是他被选中成为消灭E的人选的原因。
因为他最终也是要被消灭的（让错误和错误相互攻击抵消，是这个计划的精华之所在）。
在第一集最后史密斯被E消灭后，第二集他又复活并获得了新的能力，很多人把这解释为系统的一个失算的杀毒程序升级。
其实智慧那么高的MARIX控制者怎么会犯那么愚蠢的错误，这肯定是有计划的，史密斯SMIH获得能力后的行动也是可以预料的、
其实他的作用就是把全人类给复制，然后用他从他人那里吸收来的能力打倒E（电影里说的明白是史密斯SMIH打倒并吸收了E）。
然后系统把他和E删除掉，他的代码从所有人身上消除，所有人都同时昏厥过去，最后MARIX就抓住这个机会重新了启动。
在这个计划里，ZI的人类傻傻得收集MARIX里觉醒的人类.
fa国人也很无奈得收集着逃逸程序（不收集的话，就要他自己和HEE动手，结果就是....）.
MARIX轻松愉快得清理了系统内外的危险垃圾，这还只是顺便的，重要的是系统得到了重新启动的机会，系统的稳定性得到了保证。
这个计划最妙的地方就是可以反复使用，MARIX就这样一次次得重新启动，ZI就这样一次次的被消灭又重建（。
数代HEE一次次得出现又陨落，MARIX就这样安全运行了数个世纪。
一、《Mari》是什么？
《Mari》是一部电影，也仅仅只是一部电影--这是讨论的起点，也是由此而引发的所有解释回归的终点。
二、故事的背景：《Mari》前传
“在很久很久以后，在一个机器的国度里……“一场惨烈的人机大战后，机器最终占领和统治了地球，把人类当做能源的提供来“种植“；
与此同时，为了维系人类的繁衍生息，确保能源产量的稳定，机器通过某种机器向人类提供精神生活的假像，这就是Mari（矩阵）。
抛开计算机原理不谈，这里面有两层含义，一，Mari是机器的机器，用于生产能源，一如人类生产粮食所使用的工具；第二，Mari得以实现的原因是基于所谓的人类“意识论“（可参考网上各种关于帕拉图哲学的解说）。
Mari做为生产工具，唯一的衡量标淮是生产效率的提高。hArchic（设计师）设计的第一代Mari是按人类理想设计的一个完美的世界，原以为人人会安居乐业。
但却不想由于人类的劣根性，导致人类（或称“粮食“）大量坏死，于是，hArchic只好按照人类的实际情况设计了一个与现实（人类世纪末）相符的世界。
即便如此，人类天性中独立、自由的意识仍然不能泯灭。于是Mari之父hArchic与Mari之母racl（先知）合作，把一种“假想“的选择权赋予人类，让人类以为进出Mari是自己“自由“选择的结果，这就是Zio的由来。
可Zio的五次重建与五次毁灭，证明了人类仍然被一种循环论所控制；此外，机器也找到一种通过与人类生生不息的抗争意识做斗争的方法，不断改良和升级他们的“粮食“生产工具。